医药行业定制开发小程序的流程可以分为以下几个步骤：

1.需求分析：首先要明确小程序的目的和功能，确定所需的技术和功能模块。同时也需要考虑用户的需求和市场竞争情况等因素，制定详细的开发计划。

2.设计和原型制作：根据需求分析的结果，制定小程序的设计方案和原型。通过原型设计，可以对小程序的用户体验、功能、交互等方面进行优化，确保小程序符合用户需求。

3.开发和测试：开发团队根据需求分析和设计方案开始开发小程序，并进行系统测试、集成测试、单元测试、功能测试等，确保小程序的质量和稳定性。

4.发布和推广：小程序开发完成后，需要提交到相应的应用商店进行审核，并进行上线发布。同时也需要制定相应的推广计划，包括SEO优化、社交媒体宣传、线上广告投放等。

5.迭代优化：小程序发布后，需要不断关注用户反馈和市场变化，及时进行优化和调整。可以通过用户数据分析、市场调研等方式，了解用户需求和市场变化，不断迭代优化小程序。

总之，医药行业定制开发小程序的流程需要充分了解用户需求和市场情况，制定详细的开发计划和推广方案，并不断进行迭代优化，才能确保小程序的质量和用户体验，提高用户满意度和市场竞争力。